Региональное отделение филиала в г. Петрозаводск — Петрозаводский комплексный сектор входит в состав Отдела пути и станций института (Санкт — Петербург). Специалисты сектора выполняют весь комплекс проектно-изыскательских работ по объектам капитального ремонта пути и реконструкции верхнего строения пути.